Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms