Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLGN4YQ8NFZ3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms