Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WDR53Q7Z5U6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WDR53Q7Z5U6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms