Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SLX4IPQ5VYV7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLX4IPQ5VYV7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLX4IPQ5VYV7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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