Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL40Q2TBA0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms