Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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