Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GRIK5Q16478 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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GRIK5Q16478 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIK5Q16478 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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