Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CNGA3Q16281 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNGA3Q16281 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms