Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTMR3Q13615 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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