Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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