Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPN13Q12923 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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