Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LMO4P61968 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LMO4P61968 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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