Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms