Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GGCXP38435 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GGCXP38435 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GGCXP38435 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GGCXP38435 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms