Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms