Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX49Q9Y6V7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX49Q9Y6V7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX49Q9Y6V7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms