Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCINQ9Y6U3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCINQ9Y6U3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCINQ9Y6U3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms