Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNMT3AQ9Y6K1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT3AQ9Y6K1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT3AQ9Y6K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms