Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLIC4Q9Y696 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLIC4Q9Y696 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLIC4Q9Y696 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms