Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PHF8Q9UPP1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHF8Q9UPP1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHF8Q9UPP1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PHF8Q9UPP1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PHF8Q9UPP1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PHF8Q9UPP1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PHF8Q9UPP1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PHF8Q9UPP1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms