Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPCAL4Q9UM19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPCAL4Q9UM19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPCAL4Q9UM19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms