Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
INO80Q9ULG1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
INO80Q9ULG1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
INO80Q9ULG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
INO80Q9ULG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
INO80Q9ULG1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms