Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIX4Q9UIU6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIX4Q9UIU6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIX4Q9UIU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms