Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APEX2Q9UBZ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
APEX2Q9UBZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APEX2Q9UBZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms