Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL42Q9P2K6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL42Q9P2K6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms