Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHPF2Q9P2E5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHPF2Q9P2E5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHPF2Q9P2E5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHPF2Q9P2E5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms