Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP36Q9P275 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP36Q9P275 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP36Q9P275 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms