Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CWC25Q9NXE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CWC25Q9NXE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CWC25Q9NXE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CWC25Q9NXE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms