Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB20Q9NX57 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB20Q9NX57 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms