Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC38A7Q9NVC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC38A7Q9NVC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A7Q9NVC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A7Q9NVC3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A7Q9NVC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC38A7Q9NVC3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms