Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMT13Q9NUP7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRMT13Q9NUP7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMT13Q9NUP7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms