Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMPRSS4Q9NRS4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS4Q9NRS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms