Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLK4Q9HAZ1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLK4Q9HAZ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLK4Q9HAZ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms