Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TDRD3Q9H7E2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDRD3Q9H7E2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDRD3Q9H7E2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD3Q9H7E2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TDRD3Q9H7E2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms