Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC86Q9H6F5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC86Q9H6F5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC86Q9H6F5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms