Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SENP3Q9H4L4 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SENP3Q9H4L4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SENP3Q9H4L4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SENP3Q9H4L4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SENP3Q9H4L4 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms