Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEMA6AQ9H2E6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms