Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH19Q9H159 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH19Q9H159 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH19Q9H159 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms