Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL25Q9H0H3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL25Q9H0H3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL25Q9H0H3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms