Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LSG1Q9H089 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LSG1Q9H089 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LSG1Q9H089 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms