Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF3Q9GZM5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms