Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A8Q9C0K1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms