Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHE41Q9C0J9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BHLHE41Q9C0J9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms