Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC2Q9C0B9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZCCHC2Q9C0B9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZCCHC2Q9C0B9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms