Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RNF17Q9BXT8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RNF17Q9BXT8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms