Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TDRD1Q9BXT4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD1Q9BXT4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms