Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
WDR18Q9BV38 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
WDR18Q9BV38 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
WDR18Q9BV38 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms