Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RTKNQ9BST9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTKNQ9BST9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms