Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms