Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE1Q99829 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE1Q99829 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE1Q99829 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPNE1Q99829 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE1Q99829 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms